博士生导师（4名）

儿科医学研究所（3名）陈荣华(儿肾)、郭锡熔（儿保）、李晓南（儿保）
附属脑科医院（1名）张颖冬（神经）

科研型硕士生导师（33名）

附属脑科医院（19名）
狄晴（神经）、刘宏毅（神经外科）、过燕平（神经）、肖红（神经药理）、王小姗（神经）、石静萍（神经内科）、赵薛旭（神经）、陈一心（儿童精神）、姚志剑（精神）、谢世平（精神）、喻东山（精神）、王伟勇（精神）、蒋晓军（精神）、候刚（精神）、陈图农（应用心理）、柯晓燕（儿童心理）、欧红霞（应用心理）、张宁（应用心理）、张岩松（脑外科）

附属南京儿童医院（12名）
黄松明（儿肾）、张爱华（儿肾）、鲍华英（儿肾）、刘倩琦（内分泌）、贲晓明（新生儿）、周晓玉（新生儿）、楼跃（骨科）、赵德育（呼吸）、王大为（小儿心血管）、莫绪明（小儿心胸外科）、王凤鸣（心脏）、李晓南（儿保）
附属南京妇幼保健院（2名）童梅玲（儿保）、郭锡熔（儿保）

临床型硕士生导师（14名）

附属脑科医院（1名）孙静（精神）

附属南京儿童医院（7名）
方拥军（血液科）、沈卫民（烧伤整形外科）、顾海涛（心脏外科）、于毅（急诊）、钱小青（风湿免疫）、张儒舫（心脏外科）、徐小群（新生儿外科）

附属南京妇幼保健院（6名）
许争峰（遗传）、刘晓梅（妇产）、沈嵘（妇产）、沈宇飞（妇产）、沈晓凤（妇产）、韩树萍（妇产）

截止2007年统计